石墨坩堝的清洗需根據殘留物性質選擇適宜辦法，一起留意操作安全與坩堝維護，以下是具體的清洗辦法和留意事項：
清洗辦法
用水清洗法
    冷水清洗：將石墨坩堝放入容器中，參加適量清水，悄悄拌和后倒出清水。
    熱水清洗：先將石墨坩堝置于微溫的水中，待溫度適應后再參加熱水進行清洗。留意溫度改變不宜過快，避免導致石墨坩堝決裂。
酸清洗法
    稀酸清洗：將石墨坩堝浸入稀酸溶液中10-30分鐘，然后取出洗凈。稀酸（如鹽酸）可用于清洗無機焚燒后的殘留物，大部分是可溶的。
    濃酸清洗（需謹慎）：關于難以清洗的物質，可將石墨坩堝浸入濃酸溶液中，緩慢拌和1-3小時后取出洗凈。但濃酸清洗具有強腐蝕性，需嚴厲留意安全，并保證所運用的鹽酸不含有硝酸、硝酸鹽、鹵素和其他氧化劑。
    稀鹽酸或稀硝酸煮沸：關于仍難以清除的物質，可在稀鹽酸或稀硝酸中煮沸。清洗時可適當加熱，以進步清洗效果。
    替代方案：如果稀硝酸不能清洗干凈，可用焦硫酸鉀、碳酸鈉或硼砂熔融清洗。
高溫清洗法
    燒垢：將石墨坩堝放入干凈的坩堝內，燒至坩堝附著的沉積物悉數燒完，然后進行清洗。但高溫清洗法容易使石墨坩堝變形，不太適合用于較厚的石墨坩堝。
    高溫點火：將石墨坩堝放置在爐中，加熱至高溫，并運用氣流吹干石墨坩堝內部的殘留物。
物理沖突法
    如外表仍有污點或發黑，可用無棱角的細沙（如100篩目），用水濕潤后悄悄沖突，以康復外表光澤。
留意事項
    安全防護：在運用酸清洗法時，有必要戴好手套和口罩，堅持通風良好，防止酸液濺到皮膚或眼睛。
    坩堝維護：在清洗過程中，應防止運用硬物或尖利工具刮擦石墨坩堝，避免損壞其外表結構。
    清洗完全：清洗后應保證石墨坩堝內外無殘留物，避免影響后續運用效果。
    干燥處理：清洗后的石墨坩堝應放置在干燥通風處晾干，防止濕潤環境導致坩堝損壞。
    定時查看：定時查看石墨坩堝的完好性，如發現裂紋或破損應及時替換。